FAO最高行政官员为总干事，现任总干事为屈冬玉（中国籍）。2019年6月23日FAO第41届大会选举产生，于2019年8月1日正式履新，任期至2023年7月31日。任期四年，可连任一次。

　　总干事下设由3名副总干事、1名首席经济学家、1名首席科学家、1名总干事办公室主任组成的核心领导层，以及6名助理总干事。

　　FAO的正式职员包括在总部和权力下放办事处的签有正式长期合同（1年及以上）、由普通基金或信托基金供资的员工，包括高级管理官员（D级以上）、专业官员（P级）、国家专业官员（N级）和一般服务人员（G级）四类。

　　1.高级管理官员

　　高级管理官员是指具有一定领导或管理职衔的工作人员，包括副总干事（DDG）、首席经济学家、首席科学家、总干事办公厅主任、助理总干事（ADG）、司长（D-2/D-1）。粮农组织现有D级以上常规预算岗位编制133个。

　　2.专业官员

　　专业官员是指在特定领域从事专业技术的工作人员，分5个等级，即P1-P5。P级工作人员是FAO业务工作的核心力量，现有常规预算岗位编制1256个。

　　3.国家专业官员

　　国家专业官员是指在拥有所在国国籍并在当地从事专业工作的人员。现有常规预算岗位编制224个。

　　4.一般服务人员

　　一般服务人员是指提供后勤、行政、保安等后勤服务的工作人员，分6个等级，即G1-G6，现有常规预算岗位编制1355个。此外，FAO根据工作需要还聘用短期编外人员担任顾问工作，同时注重性别平衡，目前，FAO专业人员中男女比例已实现均等。

　　（正式职员编制数参照2021年6月第42届大会通过的《2022-23年工作计划和预算》）